Le PASTE est un outil d’édition génomique, développé par le MIT à Boston. Il est basé sur la technologie CRISPR CAS9.

C’est le début de la « chirurgie du génome » qui va permettre de s’attaquer, à la source, à la correction et au remplacement des gènes défectueux.

Ce nouvel outil d’édition génomique, baptisé PASTE (Programmable Addition via Site-specific Targeting Elements) va révolutionner la biologie et la médecine. Mis au point par des chercheurs du MIT, il combine les propriétés et avantages de l’outil Crisp Cas9 et des enzymes intégrines à serase, ce qui permet l’insertion précise dans de nombreux types de cellules (cellules hépatiques lymphocytes) de gènes entiers… 

Cet outil combine puissance, souplesse et précision. Il pourrait permettre de bloquer à la source de nombreux cancers, en supprimant des gènes altérés ou mutés et en les remplaçant par des gènes sains.

Cet outil d’une telle puissance va ouvrir un nouveau débat éthique, afin d’en déterminer clairement le champ et les limites d’application, qui doivent rester strictement thérapeutiques.

Source : MIT

La modélisation de molécules  est multipliée par un facteur 100 000 par rapport aux méthodes traditionnelles Et cela grâce à des méthodes de calculs quantiques. Exemple avec QUBIT PHARMACEUTICALS.

Qubit Pharmaceuticals est une société start up française deeptech spécialisée dans la simulation et la modélisation moléculaire grâce à l’utilisation de la physique quantique.

Elle a annoncé la création d’une plateforme visant à accélérer la découverte de médicaments par calcul hybride, classique et quantique sur le NVIDIA Quantum Optimized Device Architecture (QODA). NVIDIA est une société américaine surtout connue pour ses jeux vidéo.

La société exploite l’un des supers ordinateurs GPU les plus puissants en France dédié à la recherche médicale avec pour objectif de construire un portefeuille de candidats médicaments dans les domaines de l’oncologie, des maladies inflammatoires et des antiviraux. Dès 2023, les premiers candidats-médicaments, issus de cette collaboration, devraient être testés par des laboratoires pharmaceutiques.

La recherche de médicaments par simulation et modélisation nécessite des capacités de calcul inédites dépassant le pétaflop, soit plus d’un million de milliards d’opérations par seconde. La nouvelle plateforme combine la suie logicielle Atlas de Qubit et la puissance de calcul de NVIDIA.

En créant des jumeaux numériques des molécules physiques, la plateforme Atlas de Qubit :

• accélère les calculs d’un facteur 100.000 réalisant en quelques heures des calculs qui nécessitent plusieurs années par des voies conventionnelles.
• Alors qu’une recherche classique nécessite typiquement 5 000 synthèses moléculaires, la simulation réduit ce nombre à environ 200. La simulation permet également d’explorer en parallèle plusieurs familles chimiques, plutôt qu’en séquentiel.
• L’association de la plateforme de calcul accélérée de NVIDIA et du logiciel Atlas de Qubit vise à diviser par plus de 2 le temps nécessaire pour cribler, sélectionner un candidat médicament d’intérêt et l’optimiser ; et par plus de 10 les investissements nécessaires. 

Robert Marino, Président de Qubit Pharmaceuticals a déclaré : « Nous sommes extrêmement fiers deux années après la création de Qubit d’avoir obtenu la confiance d’un leader mondial tel que NVIDIA. En associant la puissance de calcul de NVIDIA et la capacité de simulation et de modélisation moléculaire de Qubit, nous sommes confiants dans notre capacité à réduire considérablement le temps de développement de nouveaux médicaments et de diviser par dix le coût des développements avant la pré-clinique. Cette collaboration unique au monde est également précurseur dans le domaine de la physique quantique et devrait nous permettre de développer les premiers algorithmes dans ce domaine appliqué à la découverte de médicaments. »

Craig Rhodes, EMEA Industry Lead – AI for Healthcare and Life Science, a déclaré : « Accélérer la découverte de médicaments est une priorité majeure pour NVIDIA, et nous développons du software et du hardware spécifiquement pour relever ce défi. Nous avons trouvé de grandes synergies avec Qubit et nous travaillons ensemble pour repousser les frontières de la découverte de médicaments ».

Source : QUBIT

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